Gêné par une blessure au dos tout au long de la saison, Ilkay Gündogan a néanmoins prolongé son contrat avec le Borussia Dortmund jusqu’en 2016. L’international allemand ne cache toutefois pas ses envies d’ailleurs, comme il l’a indiqué dans un entretien accordé au magazine allemand Kicker : Même si je n’ai pas joué depuis longtemps, beaucoup de clubs ont exprimé leur intérêt pour moi. Et en vérité, beaucoup de personnes considèrent que je pourrais bien m’imbriquer dans le milieu du Barça.
Non convoqué pour la Coupe du monde suite à sa saison blanche, Ilkay Gündogan avait été la révélation de l’année en Bundesliga lors de l’exercice 2012-2013.